Im Jahr 2003 wurde Dr. Gerstgraser mit dem Projektmanagement für das größte Gewässerrenaturierungsprojekte in Brandenburg betraut. Damit einher ging im Juni 2003 die Gründung des gerstgraser Ingenieurbüro für Renaturierung (gIR) in Cottbus.

Nach langjähriger Lehrtätigkeit an der Universität für Bodenkultur in Wien sowie der Technischen Universität Berlin erfolgte damit der endgültige Wechsel in die Privatwirtschaft verbunden mit dem Umzug von Wien nach Cottbus.