Mit Inkrafttreten der EU-Wasserrahmenrichtlinie (WRRL) im Jahr 2000 wurde in Europa ein für alle Mitgliedsstaaten verbindliches Regelwerk geschaffen und eine integrierte Gewässerschutzpolitik eingeleitet. Mit der Umsetzung der WRRL sollen Seen und Fließgewässer wieder naturnäher, artenreicher und sauberer werden. Zur Verwirklichung dieser Ziele wurden bis Ende 2009 Maßnahmenprogramme und Bewirtschaftungspläne für die Flusseinzugsgebiete von Elbe und Oder erarbeitet. Deren regionale Umsetzung erfolgt hauptsächlich mittels Gewässerentwicklungskonzepten (GEK). Das GEK „Cottbuser Spree“ ist eines von 64 GEK´s, die vom Landesumweltamt als prioritär eingestuft wurden. Das Gewässerentwicklungskonzept „Cottbuser Spree“ umfasst ein Untersuchungsgebiet mit einer Fläche von 6.240 ha. Es weist ein berichtspflichtiges Gewässernetz von insgesamt 57,4 km Länge auf.